遗传图谱构建；种质鉴定；遗传多样性分析；标记辅助选择（MAS，marker- assistant seletion，marker- aided seletion）；基因定位；数量性状基因座（QTL）分析；系谱分析；亲源关系鉴定等。

利用简化基因组测序技术进行大规模高通量SNP分型是当前国际上动植物基因组学研究热点。简化基因组测序是指，利用限制性内切酶对基因组进行酶切，大幅降低基因组的复杂度，对特定长度的酶切片段进行高通量测序，快速鉴定高准确性的变异标记（SNPs）信息。该技术操作简单、不受参考基因组限制；基于SNPs的分子标记技术性价比高，稳定性好，特别适合大样本量的分析。

据统计约30%细胞系被交叉污染或错误辨识[4-9]  ，因使用了交叉污染或错误辨识的细胞而导致研究结论错误、结果不可重复、临床细胞治疗灾难性后果……，这浪费大量时间、精力和金钱。